實驗原理(lǐ)
PCR 技術,即聚合酶鍊反應(polymerase chain reaction,PCR)是由美國(guó) PE Cetus 公司的(de) Kary Mullis 在 1983 年(nián)(1993 年(nián)獲諾貝爾化學(xué)獎)建立的(de)。
這項技術可(kě)在試管內(nèi)經數小時反應就将特定的(de) DNA 片段擴增數百萬倍,這種迅速獲取大量單一(yī)核酸片段的(de)技術在分子(zǐ)生物學(xué)研究中具有(yǒu)舉足輕重的(de)意義,極大地(dì)推動了生命科(kē)學(xué)的(de)研究進展。它不僅是 DNA 分析最常用的(de)技術,而且在 DNA 重組與表達、基因結構分析和(hé)功能檢測中具有(yǒu)重要的(de)應用價值。
PCR 可(kě)以被認為(wèi)是與發生在細胞內(nèi)的(de) DNA 複制過程相似的(de)技術,其結果都是以原來的(de) DNA 為(wèi)模闆産生新的(de)互補 DNA 片段。細胞中 DNA 的(de)複制是一(yī)個非常複雜的(de)過程。參與複制的(de)有(yǒu)多種因素。PCR 是在試管中進行(xíng)的(de) DNA 複制反應,基本原理(lǐ)與細胞內(nèi) DNA 複制相似,但反應體系相對較簡單。
PCR 由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構成:
① 模闆 DNA 的(de)變性:模闆 DNA 經加熱至 94℃ 左右一(yī)定時間後,使模闆 DNA 雙鍊或經 PCR 擴增形成的(de)雙鍊 DNA 解離(lí),使之成為(wèi)單鍊,以便它與引物結合,為(wèi)下輪反應做(zuò)準備;
② 模闆 DNA 與引物的(de)退火 (複性):模闆 DNA 經加熱變性成單鍊後,溫度降至 55℃ 左右,引物與模闆 DNA 單鍊的(de)互補序列配對結合;
③ 引物的(de)延伸:DNA 模闆--引物結合物在 Taq 酶的(de)作用下,以 dNTP 為(wèi)反應原料,靶序列為(wèi)模闆,按堿基配對與半保留複制原理(lǐ),合成一(yī)條新的(de)與模闆 DNA 鍊互補的(de)半保留複制鍊。
重複循環變性--退火--延伸三過程,就可(kě)獲得更多的(de)「半保留複制鍊」,而且這種新鍊又可(kě)成為(wèi)下次循環的(de)模闆。每完成一(yī)個循環需 2~4 分鐘, 2~3 小時就能将待擴目的(de)基因擴增放大幾百萬倍。
實驗試劑與器材
模闆 DNA、2.5 mmol/L dNTP
Taq DNA 聚合酶(5 U/μL)、SSR 引物
10 ×buffer、15 mmol/L Mg2+、ddH₂O
PCR 儀、移液槍、PCR 闆
實驗步驟
1.配制 20 μL 反應體系,在 PCR 闆中依次加入下列溶液:
模闆 DNA |
2 μL |
引物 1 |
1 μL |
引物 2 |
1 μL |
dNTP |
1.5 μL |
MgCl₂ |
2 μL |
10×buffer |
2 μL |
ddH₂O |
10 μL |
Taq 酶 |
0.5 μL |
2. 設置 PCR 反應程序。
3.上樣,啟動反應程序。
4.擴增産物的(de)電泳檢測。
PCR的(de)技術應用
1.生命科(kē)學(xué)
a、人類基因組計劃
随着 PCR 的(de)日臻完善,科(kē)學(xué)家于 2003 年(nián)在完成的(de)人類基因組「工作框架圖」的(de)基礎上,經過整理(lǐ)、分類和(hé)排列後得到更加準确、清晰、完整的(de)基因組圖譜。這是對人類基因組基本面貌的(de)首次揭示,表明科(kē)學(xué)家們(men)開始部分「讀」出人類生命「天書」所蘊涵的(de)內(nèi)容。
b、後基因組計劃
人類基因組 DNA 序列圖譜完成後,鑒定基因組多态性及其單倍型以及尋找其在生物和(hé)醫學(xué)應用中,成為(wèi)人們(men)關(guān)心的(de)熱點。以研究基因功能為(wèi)核心的(de)「後基因組時代」已經來臨,大規模的(de)結構基因組、蛋白質組以及藥物基因組的(de)研究計劃已經成為(wèi)新的(de)熱點。
c、物種的(de)分類、進化及親緣關(guān)系
可(kě)以進行(xíng)物種進化的(de)保守性分析、物種多态性分析及物種鑒定。
2.醫藥
a、疾病的(de)診斷和(hé)治療
遺傳性疾病,如(rú)地(dì)中海貧血、鐮刀狀細胞貧血、凝血因子(zǐ)缺乏等有(yǒu)遺傳傾向的(de)疾病,尤其是老年(nián)性疾病,如(rú)糖尿病、高(gāo)血脂症,甚至腫瘤中的(de)一(yī)部分均可(kě)預測;癌基因的(de)檢測和(hé)診斷,檢測惡性腫瘤的(de)标記物來診斷癌症等疾病;利用基因治療方法治療腫瘤性疾病。
b、緻病病原體的(de)檢測
檢測範圍包括細菌、病毒(SARS 、禽流感病毒 H5N1 等)、原蟲及寄生蟲、黴菌、立克次體、衣原體和(hé)支原體等一(yī)切微生物。檢測的(de)靈敏度和(hé)特異性都遠高(gāo)于當前的(de)免疫學(xué)方法,所需時間也已達到臨床要求,這對于難于培養的(de)病毒(乙肝),細菌(如(rú)結核、厭氧菌)和(hé)原蟲(如(rú)梅毒螺旋體)等來說尤為(wèi)适用。
c、DNA 指紋、個體識别(DNA 身份證)、親子(zǐ)關(guān)系鑒别和(hé)法醫物證
可(kě)以用一(yī)根頭發、一(yī)個細胞、一(yī)個精子(zǐ)來完成上述工作,這一(yī)領域也已發展到骨髓或髒器移植配型。
d、生物工程制藥
許多藥物可(kě)通過工程菌和(hé)細胞來大量生産,如(rú)幹擾素、白介素、促紅(hóng)細胞生長(cháng)素等藥物。
e、轉基因動物制藥及疾病模型
轉基因動物與醫學(xué)及生物醫藥研究的(de)關(guān)系越來越密切。近年(nián)來,各種人類疾病轉基因動物模型不斷建立。如(rú)轉基因動物在遺傳病、心血管疾病、腫瘤、高(gāo)血壓病、病毒性疾病、異種移植、輸血醫學(xué)、藥理(lǐ)學(xué)研究中的(de)應用。
利用轉基因動物-乳腺生物反應器生産藥物蛋白,好比在動物身上建「藥廠」,可(kě)以從動物乳汁中源源不斷地(dì)獲得具有(yǒu)穩定生物活性的(de)基因産品。這是一(yī)種全新的(de)藥物生産模式,具有(yǒu)投資成本低(dī),藥物研制周期短(duǎn)和(hé)經濟效益高(gāo)等優點。
3.農業科(kē)學(xué)
a、轉基因植物
按其功能主要分提高(gāo)産量、抗病力、抗除草(cǎo)劑、改良品質和(hé)發育調節。如(rú)大豆、玉米、馬鈴薯、番茄等。
b、轉基因動物
在農業方面,主要在改良畜禽生産性狀,提高(gāo)畜禽抗病力及利用轉基因畜禽生産非常規畜産品。
4.考古學(xué)及曆史事件解讀
利用人類短(duǎn)串聯重複 STR-PCR 技術,研究人類種族的(de)遺傳多态性,效果非常穩定。目前此技術已廣泛用于生物考古、種系發育、民族學(xué)、人類學(xué)和(hé)考古學(xué)等各個領域中。
5.衛生安全
a、食品微生物的(de)檢測
傳統的(de)緻病菌檢測首先經過長(cháng)時間的(de)培養,費時費力,應用 PCR 技術則非常迅速、準确。主要用于:食品緻病菌的(de)檢測,如(rú)肉毒唆菌等;乳酸菌的(de)檢測;水中細菌指标測定。
b、轉基因食品的(de)檢測
目前世界轉基因食品已經有(yǒu) 100 多物種,大多數已經用于食品。轉基因食品對人體健康的(de)危害及對生态的(de)影響也日受世界廣泛的(de)重視(shì),因此對轉基因食品的(de)檢測成為(wèi)控制其泛濫的(de)一(yī)種手段。
c、動、植物檢疫
靈敏、特異、快速診斷檢測方法是我(wǒ)國(guó)進出口口岸的(de)門衛,檢查出入國(guó)門的(de)人員、動、植物(種畜、種籽)等是否攜帶烈性傳染病(艾滋、動物病毒、植物病毒等)病原體,食品、飼料等是否帶沙門氏菌等均需要基因診斷手段将這些病菌拒之于國(guó)門之外,是提高(gāo)我(wǒ)國(guó)綜合國(guó)力的(de)必要保證。